通常来说，尖锐湿疣的发生和复发是多种因素作用的结果，在临床上，尖锐湿疣要想治愈是很难的，而且还有诸多的因素影响着其治疗，随时都有复发的可能性，即使是短时间内治愈了，其经过数周，甚至是数年都会引起各种原因而复发。
一、不洁性行为
通常，性生活因素是引起尖锐湿疣发生和复发的关键，通常调查发现，有多个性伴者发生尖锐湿疣的几率和复发率均明显高于单一性伴者;在一定的范围内，性生活的年龄也是尖锐湿疣的危险因素，首次性交年龄小于19岁的，其发病率及复发率均显著增加;同性恋女性的发病率明显低于非同性恋女性;男性商业性工作者是尖锐湿疣的高危人群。
二、免疫功能
对于那些免疫机能较低的人群来说，容易出现尖锐湿疣，资料表明，免疫力低下的个体如肾移植、恶性肿瘤、糖尿病、艾滋病、免疫抑制性化疗和应用糖皮质激素等情况下，尖锐湿疣的发病率及复发率均显著增加，且疣体体积也增大。
三、年龄和性别
年龄是尖锐湿疣的独立危险因素，80%的尖锐湿疣发生于16～34岁，高峰年龄为20～25岁。男性平均发病年龄为22岁，女性为19岁;男女发病比例约为1∶1.4。另一研究发现，女性年龄小于25岁是肛门生殖器疣的危险因素。
四、患其他性病
尖锐湿疣与其他性传播疾病如生殖器疱疹、淋病、梅毒、艾滋病等密切相关，其原因一是尖锐湿疣与其他性病有共同的危险性行为;二是一些性病的病原体破坏了黏膜屏障，使机体抵御HPV的能力下降。
专家认为尖锐湿疣的病程是很长的，可能会持续数年，但是只要治疗就可避免其复发，另外，治疗尖锐湿疣还要注意养与治相互结合，平时注意护理和保养，增强体质有助于尖锐湿疣的治疗和康复。